Votre médecin vérifie probablement votre tension artérielle, votre cholestérol et votre glycémie. Mais il existe un « score de santé » moins connu qui façonne silencieusement votre métabolisme, votre inflammation et même votre humeur : le ratio Firmicutes-Bactéroïdes dans votre intestin.
Cette mesure à la bouche pleine—souvent appelée ratio F/B—pourrait aider à expliquer pourquoi deux personnes peuvent manger le même repas et pourtant prendre du poids, se sentir ballonnées ou développer des problèmes métaboliques de manière très différente.
Qu’est-ce que le Ratio Firmicutes-Bactéroïdes ?
À l’intérieur de votre intestin vit une communauté dense de microbes—des milliards de bactéries, ainsi que des champignons et des virus—collectivement appelée le microbiote intestinal. Deux grandes « familles » bactériennes dominent cet écosystème : les Firmicutes et les Bactéroïdes. Ensemble, elles représentent généralement plus de 90 % des bactéries présentes dans l’intestin humain.
Firmicutes : Un groupe très large qui comprend des espèces comme Lactobacillus, Clostridium, Ruminococcus et Faecalibacterium. Beaucoup d’entre elles sont des championnes pour extraire l’énergie des aliments et produire des acides gras à chaîne courte (AGCC) tels que le butyrate, qui nourrit les cellules du côlon et soutient l’intégrité de la barrière intestinale.
Bactéroïdes : Comprend des genres tels que Bacteroides et Prevotella. Ces bactéries excellent à décomposer les glucides complexes et les fibres en d’autres AGCC et métabolites qui influencent le métabolisme, les réponses immunitaires et l’inflammation.
Le ratio F/B compare simplement l’abondance relative de ces deux phyla dans votre microbiote intestinal.
Par exemple :
Si votre intestin est composé de 60 % de Firmicutes et de 30 % de Bactéroïdes, votre ratio F/B est de 2:1.
S’il est composé de 30 % de Firmicutes et de 60 % de Bactéroïdes, votre ratio F/B est de 0,5:1.
Chez les personnes en bonne santé, les études montrent une énorme fourchette naturelle : les Firmicutes peuvent varier d’environ 11 % à 95 % et les Bactéroïdes d’environ 0,6 % à 86,6 %. Cela signifie qu’il n’existe pas de nombre « parfait » unique, mais les patterns racontent encore une histoire intéressante.
Pourquoi le Ratio Firmicutes-Bactéroïdes est Devenu Célèbre et Controversé
Le ratio F/B a explosé en popularité lorsque les premières recherches l’ont lié à l’obésité et aux maladies métaboliques.
L’histoire originale : plus de Firmicutes, plus de kilos ?
Les premiers travaux sur les animaux et les humains ont montré que :
Certains sujets en surpoids et obèses présentaient des Firmicutes plus élevés et des Bactéroïdes plus faibles, ce qui se traduisait par un ratio F/B plus élevé que chez les personnes minces.
Des souris obèses transplantées avec un microbiote riche en Firmicutes ont pris plus de graisse que des souris minces ayant reçu un microbiote différent, même en mangeant les mêmes calories, ce qui suggère une extraction énergétique accrue des aliments.
Les régimes de type occidental riches en graisses avaient tendance à pousser le microbiote vers relativement plus de Firmicutes, tandis que les régimes traditionnels riches en fibres favorisaient les Bactéroïdes.
Sur cette base, les chercheurs ont proposé que les Firmicutes sont plus efficaces pour extraire les calories, favorisant potentiellement la prise de poids, tandis que les Bactéroïdes étaient considérés comme « favorables à la minceur », liés aux régimes riches en fibres et à une moindre extraction énergétique.
Une revue de 2024 note que le ratio F/B est rapidement devenu une « marque microbienne » de l’excès de poids corporel, en particulier de l’obésité, dans la littérature.
Le rebondissement : ce n’est pas si simple
Au fur et à mesure que davantage de données arrivaient, l’histoire s’est compliquée :
Certaines études ont effectivement reproduit le pattern : un ratio F/B plus élevé dans l’obésité et les dysfonctions métaboliques.
D’autres études n’ont pas réussi à trouver un lien cohérent, ou ont même trouvé des tendances opposées une fois que l’alimentation, l’âge, les médicaments et la géographie ont été contrôlés.
Une revue systématique de 2023 a souligné que si le ratio F/B est un marqueur de dysbiose, les résultats d’une étude à l’autre sont hétérogènes et dépendent du contexte.
La réflexion actuelle est plus nuancée :
Le ratio F/B est un signal écologique large, pas un outil de diagnostic précis.
La diversité globale, les espèces spécifiques (par exemple Faecalibacterium prausnitzii ou Akkermansia muciniphila), et les résultats fonctionnels (comme la production d’AGCC) peuvent avoir plus d’importance que le simple ratio au niveau du phylum.
En d’autres termes, c’est un indice utile—mais pas un verdict autonome sur votre santé.
Ce Que Votre Ratio F/B Pourrait Vous Dire
Même s’il est imparfait, votre ratio F/B peut mettre en évidence des tendances dans la fonction intestinale qui recoupent des symptômes concrets.
1. Extraction énergétique et régulation du poids
Des études tant chez l’animal que chez l’humain suggèrent qu’un ratio F/B plus élevé (plus de Firmicutes par rapport aux Bactéroïdes) peut être associé, dans certains contextes, à :
Une plus grande extraction de calories à partir de la même quantité d’aliments.
Un IMC plus élevé ou une tendance à la prise de poids.
Des régimes plus riches en graisses, en sucre et en protéines animales.
Par exemple :
Des recherches chez les enfants ont lié des Bactéroïdes plus faibles et des groupes Bacteroides/Prevotella plus faibles à un IMC plus élevé, tandis que certaines données associent les Firmicutes à la prise de poids.
Des études classiques ont montré que lorsque des personnes obèses étaient placées sous un régime hypocalorique, leurs niveaux de Bactéroïdes augmentaient, leur ratio F/B changeait, et ce changement suivait la perte de poids au fil du temps.
Cependant, des études ultérieures soulignent qu’une fois la qualité de l’alimentation pleinement prise en compte, l’association entre le ratio F/B et l’obésité peut s’affaiblir ou disparaître. Ainsi, le ratio peut être davantage un reflet de votre alimentation et de votre mode de vie qu’une cause déterministe du poids.
2. Inflammation et équilibre immunitaire
Vos microbes intestinaux communiquent constamment avec votre système immunitaire. Les déséquilibres du ratio F/B voyagent souvent avec d’autres caractéristiques de dysbiose—comme une diversité réduite ou la prolifération d’espèces potentiellement pro-inflammatoires.
Un ratio F/B élevé a été lié, dans certaines cohortes, à :
Une perméabilité intestinale accrue (« intestin perméable ») et une inflammation systémique de bas grade.
Des marqueurs inflammatoires élevés et des associations avec la stéatose hépatique non alcoolique (NAFLD), la fibrose hépatique et la stéatose.
Des modifications de la régulation immunitaire pouvant affecter le risque auto-immun ou les allergies.
Mécaniquement :
Certaines espèces de Firmicutes sont corrélées à un apport énergétique plus élevé et à des marqueurs comme la protéine C-réactive (CRP), un marqueur inflammatoire.
La perte de Firmicutes anti-inflammatoires producteurs de butyrate comme Faecalibacterium prausnitzii est liée à une inflammation métabolique plus sévère et au diabète de type 2.
Des niveaux plus faibles d’espèces soutenant la barrière comme Akkermansia muciniphila (d’un autre phylum, Verrucomicrobia) accompagnent souvent l’obésité et la dysbiose, compliquant l’histoire simple du F/B.
Ainsi, le ratio F/B n’agit pas seul—il a tendance à évoluer de concert avec des changements fonctionnels plus profonds dans l’écosystème immunitaire de votre intestin.
3. Métabolisme, foie et axe intestin-foie
Votre foie et votre intestin sont en conversation constante via la veine porte. Plusieurs études associent des ratios F/B anormaux à des problèmes hépatiques :
Dans la stéatose hépatique non alcoolique, les changements du F/B sont corrélés aux degrés de fibrose et de stéatose, surtout lorsqu’ils sont combinés à un IMC plus élevé.
Des ratios F/B plus élevés ont été associés à un indice de tissu hépatique (LTI) élevé et à d’autres marqueurs de charge hépatique dans certaines cohortes.
Ces observations soutiennent l’idée que votre équilibre F/B fait partie d’un triangle intestin–foie–métabolisme plus large, où l’alimentation, les métabolites microbiens et l’inflammation s’alimentent mutuellement.
Pourquoi Votre Médecin Ne Prescrit Pas Encore le Test du Ratio Firmicutes-Bactéroïdes
Compte tenu de tout cela, pourquoi le ratio Firmicutes-Bactéroïdes n’est-il pas standard sur votre bilan de laboratoire ?
1. Énorme variabilité naturelle
Comme mentionné, les individus en bonne santé peuvent avoir des proportions extrêmement différentes de Firmicutes et de Bactéroïdes—les Firmicutes variant d’environ 11 à 95 % et les Bactéroïdes d’environ 0,6 à 86,6 % selon les cohortes.
Cela signifie :
Un ratio F/B « élevé » ou « faible » pour une personne pourrait être normal pour une autre.
Les moyennes de population ne se traduisent pas automatiquement par un seuil individuel significatif.
2. C’est un instrument grossier
Le ratio F/B regroupe des milliers d’espèces, dont certaines sont bénéfiques, d’autres neutres, et d’autres potentiellement nuisibles.
Par exemple :
Bons Firmicutes : producteurs de butyrate comme Faecalibacterium prausnitzii qui réduisent l’inflammation et soutiennent la fonction de barrière intestinale.
Firmicutes moins utiles : certaines espèces de Staphylococcus ou des souches de Lactobacillus reuteri qui corrèlent avec un apport énergétique plus élevé ou des marqueurs inflammatoires dans l’obésité.
Les Bactéroïdes vont également des dégradeurs de fibres bénéfiques aux espèces pouvant déclencher des problèmes dans certaines conditions.
Ainsi, un résultat « Firmicutes élevé » ne signifie pas automatiquement « mauvais », et un résultat « Bactéroïdes élevé » ne signifie pas automatiquement « bon ».
3. Les méthodes et plateformes diffèrent
Les études utilisent différentes :
Méthodes d’extraction d’ADN.
Plateformes de séquençage.
Pipelines bioinformatiques et bases de données taxonomiques.
Même lorsque les chercheurs ont tenté de normaliser les pipelines entre les ensembles de données, une grande variabilité est restée dans les ratios F/B rapportés. Cela rend difficile la définition de fourchettes de référence universelles qui seraient cliniquement exploitables.
4. Les directives cliniques n’ont pas rattrapé leur retard
Malgré la popularité du ratio F/B dans la recherche et les startups de la santé intestinale, les grandes sociétés médicales ne le recommandent pas encore comme marqueur de diagnostic de routine.
Les résumés d’experts récents soulignent que :
Le ratio F/B doit être interprété avec des données de microbiote plus riches : diversité, espèces spécifiques et contexte clinique.
La richesse microbienne globale et les voies fonctionnelles spécifiques peuvent être des cibles plus importantes que le seul ratio au niveau du phylum.
Ainsi, votre médecin n’ignore pas votre intestin ; la science n’est tout simplement pas encore au niveau des « soins standards » pour cette mesure spécifique.
Pouvez-Vous Tester Votre Ratio F/B Aujourd’hui ?
Oui. Plusieurs services commerciaux de microbiote et laboratoires fonctionnels proposent des tests de selles qui estiment votre ratio F/B dans le cadre d’un profil intestinal plus large.
Typiquement, ces tests :
Utilisent le séquençage de l’ADN bactérien dans vos selles.
Calculent les abondances relatives des phyla bactériens, y compris les Firmicutes et les Bactéroïdes.
Fournissent votre ratio F/B, souvent avec une « fourchette » codée par couleur et un commentaire interprétatif.
Par exemple, certains fournisseurs expliquent que :
Un ratio F/B équilibré est un signe (parmi beaucoup d’autres) de résilience intestinale, surtout lorsqu’il est associé à une grande diversité et une production robuste d’AGCC.
Un ratio déséquilibré peut voyager avec une diversité plus faible, moins de producteurs d’AGCC, ou l’expansion de taxons associés à l’inflammation.
L’« optimal » varie d’une personne à l’autre, et la question la plus pratique est de savoir si votre pattern correspond à vos symptômes, votre alimentation et vos objectifs.
Avertissement important : ces rapports ne sont pas des tests de diagnostic approuvés par la FDA et doivent être traités comme des outils informatifs plutôt que comme des diagnostics définitifs.
Comment Orienter Votre Ratio Firmicutes-Bactéroïdes Vers une Direction Plus Saine
Vous ne pouvez pas micro-gérer votre microbiote pour atteindre un ratio F/B magique, et vous ne devriez probablement pas essayer. Mais vous pouvez façonner l’écosystème global de manière à améliorer à la fois ce ratio et des marqueurs fonctionnels plus importants.
La recherche pointe plusieurs leviers :
1. Mettez l’accent sur des aliments végétaux diversifiés et riches en fibres
Des Bactéroïdes plus élevés et un ratio F/B plus favorable sont souvent associés à des régimes riches en fibres et à base de plantes.
Les régimes riches en fibres fermentescibles (légumes, légumineuses, céréales complètes, noix, graines) soutiennent la croissance des Bactéroïdes et des Firmicutes producteurs d’AGCC.
Les régimes ruraux traditionnels riches en fibres sont associés à des Bactéroïdes plus élevés et des Firmicutes plus faibles par rapport aux régimes occidentaux riches en graisses et en sucre.
Mesures concrètes :
Visez 20 à 30+ aliments végétaux différents par semaine (comptez les fruits, légumes, légumineuses, céréales, noix et graines).
Incluez des sources d’amidon résistant comme les pommes de terre refroidies, les bananes verdâtres ou les lentilles.
2. Réduisez les aliments ultra-transformés, riches en graisses et en sucre
À plusieurs reprises, les régimes occidentaux riches en graisses et en sucre sont liés à des patterns du microbiote qui incluent des Firmicutes plus élevés, une diversité réduite et une dysbiose.
Bien que la graisse elle-même ne soit pas « mauvaise », un pattern de :
faible teneur en fibres
forte teneur en sucre raffiné
consommation fréquente d’aliments ultra-transformés
tend à favoriser des ratios F/B moins favorables et des marqueurs de dysbiose plus larges.
3. Soutenez les producteurs d’AGCC (en particulier le butyrate)
L’objectif n’est pas « moins de Firmicutes », mais une composition plus saine au sein des Firmicutes :
Encouragez les producteurs de butyrate comme Faecalibacterium prausnitzii avec des fibres fermentescibles et éventuellement des prébiotiques ciblés.
Réduisez les conditions qui favorisent l’expansion des Firmicutes pro-inflammatoires, comme la suralimentation chronique, la consommation fréquente de malbouffe et le stress non maîtrisé.
Lorsque la production d’AGCC est robuste :
La fonction de barrière intestinale a tendance à s’améliorer.
La signalisation inflammatoire diminue souvent.
L’environnement intestinal devient plus accueillant pour les espèces bénéfiques à la fois chez les Firmicutes et les Bactéroïdes.
4. Gérez le poids et la santé métabolique de manière holistique
Les interventions de perte de poids qui améliorent la santé métabolique—comme le contrôle des calories, l’augmentation de l’activité physique et l’amélioration de la qualité de l’alimentation—entraînent souvent :
une augmentation de l’abondance des Bactéroïdes.
une normalisation des ratios F/B élevés.
une amélioration de la sensibilité à l’insuline et des marqueurs inflammatoires.
Cela ne signifie pas que votre microbiote est le seul moteur, mais il semble évoluer parallèlement à un métabolisme plus sain.
5. Surveillez les médicaments et les facteurs de stress liés au mode de vie
Les facteurs non alimentaires remodèlent également l’équilibre F/B :
Les antibiotiques à large spectre peuvent perturber considérablement à la fois les Firmicutes et les Bactéroïdes, parfois à long terme.
Le stress chronique, le mauvais sommeil et un mode de vie sédentaire sont tous associés à des changements du microbiote et à une augmentation de la tonalité inflammatoire.
Bien que l’impact exact sur le ratio F/B diffère selon les études, le pattern est clair : votre microbiote réagit à votre mode de vie.
Comment Utiliser le Ratio F/B : Information Sans Obsession
Alors, que faites-vous avec ce « score de santé secret » que votre médecin ne prescrit pas encore ?
Une façon pratique de penser à votre ratio F/B :
C’est un aperçu macro de votre écosystème intestinal, comme un bulletin météo plutôt qu’une coordonnée GPS.
Un ratio élevé ou faible n’est pas une fatalité ; c’est une incitation à regarder la qualité de l’alimentation, l’inflammation, la santé métabolique et les symptômes.
Il est plus utile lorsqu’il est interprété avec :
la diversité globale.
les espèces spécifiques bénéfiques ou nuisibles.
votre tableau clinique et les marqueurs de laboratoire comme la glucose, les lipides et la CRP.
Si vous voyez votre ratio F/B dans un rapport de microbiote :
Traitez-le comme un lanceur de conversation, pas comme un score à atteindre.
Utilisez-le pour renforcer les fondamentaux : fibres, aliments entiers, mouvement, sommeil, gestion du stress.
Discutez des résultats avec un clinicien ou un professionnel de la nutrition qui comprend la science du microbiote et peut les placer dans le contexte de vos antécédents de santé.
Le vrai secret est que la santé intestinale ne consiste pas à hacker un seul nombre. Il s’agit de cultiver une communauté microbienne résiliente et diversifiée qui travaille avec vous, pas contre vous—et le ratio Firmicutes-Bactéroïdes n’est qu’une fenêtre sur ce monde intérieur.
Sources

